特异性识别阿奇霉素的单链DNA适配体序列及其应用
专利名称：
特异性识别阿奇霉素的单链DNA适配体序列及其应用
发明/设计人：
周楠迪;张雨婷;王晓丽;黄天宇
申请/专利权人：
江南大学
专利类型：
发明专利
申请时间：
2023-12-19
申请/专利号：
CN202311752426.8
公开(公告)号：
CN117487813A
主分类号：
C12N15/115
分类号：
G01N33/53;C12N15/115;G01N33/58;G01N21/64;C12N15/10
申请地区：
214000 江苏省无锡市通沙路898号南楼七层
代理人：
张静杰
专利代理机构：
苏州市中南伟业知识产权代理事务所(普通合伙)
摘要：
本发明公开了特异性识别阿奇霉素的单链DNA(ssDNA)适配体及其应用。通过磁珠-SELEX技术,将双链DNA文库固定至磁珠,加入阿奇霉素竞争置换有亲和力的序列的方法,经过数轮正筛选和反筛选,根据高通量测序富集数和序列同源性比对,挑选Apt3进行亲和力和特异性验证,并对最佳适配体Apt3进行截短优化和单碱基突变优化。最后得到一条长度为27个核苷酸的适配体Apt3-27T,该适配体对阿奇霉素的亲和力较原始适配体有所提高,并且能有效区分阿奇霉素和其结构类似物红霉素,对阿奇霉素有高度特异性,因此被选作最优阿奇霉素适配体。本发明为阿奇霉素检测提供了性能优良的识别元件...
